2004-2005-жылдар аралыгында Афганистан менен Пакистанда иштеп келген чалгындоо агенттиктеринин отчетторунда Хаккани Тармак террористтик тобу пайда боло баштаган. Тармактын аталышы советтик аскерлерге каршы согушкан талаа командири Джалалуддин Хакканинин ысымы менен байланыштуу.
Советтик аскерлер Афганистанда жүргөндө, Жалалуддин Хаккани белгилүү талаа командири болгон, аны АКШнын Борбордук чалгындоо башкармалыгы колдоп, каржылык жардам көрсөткөн.
Советтик аскерлер чыгарылып кеткенден кийин Ооганстанда жарандык согуш уланган. Хаккани бир нече ири операцияларга катышкан, анын авторитети бир топ өстү. 1992-жылы ал согушуп жаткан тараптардын тынчтык сүйлөшүүлөрүнө катышкан, андан кийин Афганистандын Юстиция министри болуп, бул кызматты төрт жыл аркалаган.
1996-жылы Кабул Талибан тарабынан кармалгандан кийин Хаккани алардын тарабына өтүп, Чек ара министри болуп дайындалган. Иш жүзүндө, бул анын кийинчерээк америкалыктар тарабынан талкаланган Аль-Каиданын машыгуу лагерлери жайгашкан Пактиа провинциясын толугу менен көзөмөлдөп тургандыгына алып келди. АКШнын Талибанга каршы операциясы башталгандан кийин Хаккани алардын куралдуу күчтөрүн башкарууга киришти, бирок баскынчыларга туруштук бере алган жок. Талибандар талкаланды, Хаккани партизандык согуш жүргүзө баштады жана көп өтпөй америкалыктар Талибандын эң көп изделип жаткан террористтеринин бири деп аташты.
Хакканинин өкмөттүк күчтөргө жана АКШ армиясына каршы иш-аракеттери абдан ийгиликтүү болду, анткени 2000-жылдардын ортосунан тартып Ооганстандан "Хаккани Тармагы" жөнүндө сөз башталды, бул согуш башчысынын таасири күчөгөнүн көрсөттү. 2006-жылдан бери Хаккани менен бирге анын уулу Сиражуддин (Сираж) тармакты башкарып келген. 2007-жылдан бери атасынын ден-соолугунун начарлашына байланыштуу топту Сираж башкарган. Талибан менен тыгыз байланышта болгон Хаккани террордук тобу ошого карабастан өз алдынча иш алып барган жана эч кимге баш ийген эмес.
Көп өтпөй "Хаккани Тармагынын" жетекчилигине анын негиздөөчүсүнүн үй-бүлө мүчөлөрү жана бир катар талаа командирлери кирген, топ Афганистандын бир нече провинциясын көзөмөлдөп турган. 2008-жылдан бери топ жанкечтилерди террордук актыларды жасоо үчүн колдоно баштаган, АКШ бийлиги аны Ооганстандагы америкалык аскерлерге эң чоң коркунуч туудурган нерсе деп эсептей баштаган. Атайын кызматтардын маалыматы боюнча, тармактын мүчөлөрүнүн саны 2010-жылы 4 миңден 15 миң адамга чейин болгон. Топтун жабык экендигинен улам согушкерлердин санын тактап айтуу кыйынга турду.
2008-жылдан бери топтун негиздөөчүсү Сираж Хаккани уулу АКШ тарабынан террорчулардын тизмесине киргизилген, 2009-жылдан бери ал жөнүндө маалымат үчүн 5 миллион доллар сыйлык жарыяланган. Кийинки жылдары террорчулардын тизмесине Насируддин Хаккани, Халил аль-Рахман Хаккани жана Бадруддин Хаккани кошулган.
Көптөн бери АКШ бийлиги "Хаккани Тармагын" расмий түрдө террористтик топтордун катарына кошууга батына алган жок, анткени алар дагы деле болсо ушундай таасирдүү кыймылдын лидерлери менен тил табышууга үмүттөнүшкөн. Өлкөнүн чалгындоо кызматтары жада калса тармактын өкүлдөрү менен жолугушууларды өткөрүп, бирок алар эч кандай келишимге жетише алышкан жок.
Акыры 2011-жылдын сентябрь айында Хаккани түйүнүнүн террорчулары НАТО күчтөрүнүн баш кеңсесине жана АКШнын Кабулдагы элчилигине кол салган учурда кырдаал оңолду. 16 адам кол салуунун курмандыгы болду. Террорчулар менен тил табышуу мүмкүн эместиги айдан ачык болуп, 2012-жылдын сентябрь айында АКШ Хаккани тармагын террордук топтордун катарына кошкону жарыяланган.
